L'unité de référence du sud-est du Yukon comprend les régions écologiques du bassin de la rivière Liard, du plateau Muskwa et du massif Hyland. Le bassin de la Liard est caractérisé par des collines vallonneuses, des vallées et des basses terres boisées renfermant le plus riche potentiel pour la production forestière du Yukon. La région écologique du massif Hyland se caractérise par un relief bas et par de larges collines et plateaux ondoyants. Les vallées sont étroites et profondes, et rares sont les points situés au-dessus de la ligne des arbres. Une petite portion du plateau Muskwa fait partie de l'extrême est de l'unité de référence du centre du Yukon. Cette région écologique boréale située au cœur de la cordillère longe le piémont des montagnes Rocheuses situées dans le nord-est de la Colombie-Britannique et une partie du Yukon, et elle couvre la limite des Territoires du Nord-Ouest.